京橋のバイオインフォマティシャンの日常

まずは、データ分析、コマンドラインのメモとして

Rのジミ〜な小技シリーズ

【Rのジミ〜な小技シリーズ】データ解析の前処理で悩まされるデータ重複の問題を扱ってみた件

本記事は、 skume.hatenablog.com の続編である。 さて、これからデータ解析を始めようかという時に、まずやることは該当データのクオリティチェック(品質評価)だろう。 クオリティチェックと言っても、いろいろな方法・考え方があって、データによって様…

【Rのジミ〜な小技シリーズ】ベクトルに「含まれる」「含まれない」要素の取り出し、論理値について

ある数値・文字列が、こっちのベクトルにも含まれるのか、何番目に出現するのか等を考えると、しばしば悩ましい状況がある。 このような、ベクトル間の関係性を調べる方法を紹介する。 (1)あるベクトルから他ベクトルに「含まれる要素」あるいは「含まれ…

【Rのジミ〜な小技シリーズ】Rのどぎついレインボー・カラーを和らげて、使える色へと変換するTipsについて

楽なので、Rのplot()時に、レインボー色(grDevices::rainbow)を使うんだけど、 お世辞にも良い色とは言えず、ドギツイ色を使うねと周囲から言われる。 今回、それを挽回するために、そのレインボー色を和らげる方法を紹介する。 rainbow関数では、16進数で…

【Rのジミ〜な小技シリーズ】時々にしたくなる、Rの古いバージョンのパッケージ(The previous version packages)をインストールする件

Rを使っていると、稀に、パッケージのバージョン違いで問題が起こる。 そのとき、以前のバージョンのパッケージをインストールする必要がでてくる。 以前のバージョンをインストールする場合には、まず、CRANのパッケージのページにいく。 例えば、psychパッ…

【Rのジミ〜な小技シリーズ】エクセルのセルをコピーして、クリップボードのまま、Rのread.tableでデータフレームとして直接読み込む時の方法

今までほぼやってなかったけど、さっき使ってみて思いの外便利だったので、今後はこれを使いたいと強いメッセージを込めて、これのみでメモっておく。 まずは、エクセルの任意のセルを選択して、command + c でコピーする。 Rを起動して、以下のコマンドを打…