京橋のバイオインフォマティシャンの日常

南国のビーチパラソルの下で、Rプログラムを打ってる日常を求めて、、Daily Life of Bioinformatician in Kyobashi of Osaka

インタラクティブ図示

R言語でヒートマップ入門:インタラクティブなヒートマップでデータ分析をもっと楽しくしよう!!

はじめに 実行環境 Rパッケージの読み込み heatmap3パッケージを用いた、ハイカラなヒートマップ表現 heatmap3でのヒートマップ作成(1)シンプルなヒートマップ heatmap3でのヒートマップ作成(2)少し複雑なヒートマップ heatmaplyパッケージを使った、ヒ…

htmlwidgets for R のShowcaseにあるパッケージがCodePenでブログ表示できるかを調べた件

はじめに とりあえず、結果 表示結果 Leaflet Dygraphs networkD3 d3heatmap DataTables MetricsGraphics まとめ はじめに htmlwidgets for R パッケージは、Rでインタラクティブな図が作成できる王道的なパッケージであり、 それを使った色々な依存パッケー…

R言語で、jsTree・jsTreeR パッケージを使った、 インタラクティブなツリーリスト表示をやってみた件

はじめに jsTreeを使ったツリーリスト表示 事前準備をする jsTreeを使った実行例(1) jsTreeを使った実行例(2) jsTreeを使った実行例(3) jsTreeを使った実行例(4) jsTreeRを使ったツリーリスト表示 事前準備をする jsTreeRを使った実行例(1) j…

【R言語】データサイズ・行数が異なるテキストファイルにおけるファイル読み込み関数の速度比較

はじめに 実行環境 検証用のファイル生成 opensslコマンドを用いた、ランダム文字列の生成 echoとtrコマンドを用いた文字列の生成 seqコマンドを用いた連番数字の生成 seqコマンドを用いた検証用ファイルの生成 Rでのファイル読み込み検証 utils::read.table…