京橋のバイオインフォマティシャンの日常

まずは、データ分析、コマンドラインのメモとして

インタラクティブ図示

【R言語】データサイズ・行数が異なるテキストファイルにおけるファイル読み込み関数の速度比較

最近、数GBを超えるテキストデータを扱うようになり、今更ながら、Rのファイル読み込み関数の速度比較について一度検討してみた。 今回、以下の3つのファイル読み込み関数について調査してみた。 utils::read.table関数 data.table::fread関数 readr::read_…

htmlwidgets for R のShowcaseにあるパッケージがCodePenでブログ表示できるかを調べた件

htmlwidgets for R パッケージは、Rでインタラクティブな図が作成できる王道的なパッケージであり、それを使った色々な依存パッケージが開発されている。 www.htmlwidgets.org 今回、htmlwidgetsのshowcaseにある12パッケージをHatena Blog内の図表として…